このコースについて
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次における8の6コース

100%オンライン

自分のスケジュールですぐに学習を始めてください。

柔軟性のある期限

スケジュールに従って期限をリセットします。

約17時間で修了

英語

字幕:英語

習得するスキル

BioinformaticsBioconductorGenomicsR Programming

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このCourseを受講している学習者は

  • Biostatisticians
  • Biologists
  • Scientists
  • Researchers
  • Data Scientists

シラバス - 本コースの学習内容

1
3時間で修了

Week One

16件のビデオ (合計126分), 3 readings, 1 quiz
16件のビデオ
Installing R on A Mac 2 分
Installing R Studio on a Mac 1 分
What is Bioconductor7 分
Installing Bioconductor3 分
The Bioconductor Website9 分
Useful Online Resources5 分
R Base Types18 分
GRanges - Overview4 分
IRanges - Basic Usage12 分
GenomicRanges - GRanges8 分
GenomicRanges - Basic GRanges Usage8 分
GenomicRanges - seqinfo6 分
AnnotationHub8 分
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 112 分
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 213 分
3件の学習用教材
Welcome10 分
Syllabus10 分
Pre Course Survey10 分
1の練習問題
Quiz 120 分
2
2時間で修了

Week Two

8件のビデオ (合計81分), 1 quiz
8件のビデオ
BSgenome6 分
Biostrings - Matching6 分
BSgenome - Views9 分
GenomicRanges - Rle12 分
GenomicRanges - Lists6 分
GenomicFeatures18 分
rtracklayer - Data Import14 分
1の練習問題
Quiz 220 分
3
2時間で修了

Week Three

9件のビデオ (合計79分), 1 quiz
9件のビデオ
Annotation Overview4 分
ExpressionSet Overview4 分
ExpressionSet9 分
SummarizedExperiment7 分
GEOquery6 分
biomaRt13 分
R S4 Classes16 分
R S4 Methods10 分
1の練習問題
Quiz 320 分
4
2時間で修了

Week Four

7件のビデオ (合計81分), 1 reading, 1 quiz
7件のビデオ
Short Read4 分
Rsamtools12 分
oligo14 分
limma16 分
minfi11 分
Count-based RNA-seq analysis15 分
1件の学習用教材
Post Course Survey10 分
1の練習問題
Quiz 420 分
4.0
38件のレビューChevron Right

Bioconductor for Genomic Data Science からの人気レビュー

by GKAug 28th 2019

Before you can run, you must learn to walk.\n\nKasper's well paced tutorials will give you confidence using the tools you need for genomic study.

by MAMar 12th 2016

Excellent introduction to Bioconductor. Thanks to the team. However, absence of inputs from TA or Instructor was felt in the discussion.

講師

Avatar

Kasper Daniel Hansen, PhD

Assistant Professor, Biostatistics and Genetic Medicine
Bloomberg School of Public Health

ジョンズ・ホプキンズ大学(Johns Hopkins University)について

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Genomic Data Science専門講座について

With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome. This Specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, along with a variety of software implementation tools like Python, R, Bioconductor, and Galaxy. This Specialization is designed to serve as both a standalone introduction to genomic data science or as a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics, for scientists in these fields seeking to gain familiarity in data science and statistical tools to better interact with the data in their everyday work. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit. Please note that you will not receive a Certificate of Completion if you choose to Audit....
Genomic Data Science

よくある質問

  • 修了証に登録すると、すべてのビデオ、テスト、およびプログラミング課題(該当する場合)にアクセスできます。ピアレビュー課題は、セッションが開始してからのみ、提出およびレビューできます。購入せずにコースを検討することを選択する場合、特定の課題にアクセスすることはできません。

  • コースに登録する際、専門講座のすべてのコースにアクセスできます。コースの完了時には修了証を取得できます。電子修了証が成果のページに追加され、そこから修了証を印刷したり、LinkedInのプロフィールに追加したりできます。コースの内容の閲覧のみを希望する場合は、無料でコースを聴講できます。

さらに質問がある場合は、受講者向けヘルプセンターにアクセスしてください。