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初級レベル

約11時間で修了

推奨:12-18 hours of videos and labs...

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字幕:英語

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シラバス - 本コースの学習内容

1
3時間で修了

Protein Motifs

In this module we'll be exploring conserved regions within protein families. Such regions can help us understand the biology of a sequence, in that they are likely important for biological function, and also be used to help ascribe function to sequences where we can't identify any homologs in the databases. There are various ways of describing the conserved regions from simple regular expressions to profiles to profile hidden Markov models (HMMs).

...
4件のビデオ (合計34分), 4 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture21 分
Lab Discussion9 分
Summary1 分
4件の学習用教材
Acknowledgements10 分
Course Logistics10 分
Lecture Materials10 分
Lab 1 -- Protein Domain, Motif and Profile Analysis1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 1 Quiz6 分
2
2時間で修了

Protein-Protein Interactions

In this module we'll be exploring protein-protein interactions (PPIs). Protein-protein interactions are important as proteins don't act in isolation, and often an examination of the interaction partners (determined in an unbiased, perhaps high throughput way) of a given protein can tell us a lot about its biology. We'll talk about some different methods used to determine PPIs and go over their strengths and weaknesses. In the lab we'll use 3 different tools and two different databases to examine interaction partners of BRCA2, a protein that we examined in last module's lab. Finally, we'll touch on a "foundational" concept, Gene Ontology (GO) term enrichment analysis, to help us understand in an overview way the proteins interacting with our example.

...
4件のビデオ (合計37分), 2 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture23 分
Lab Discussion11 分
Summary1 分
2件の学習用教材
Lecture Materials10 分
Lab 2 -- Protein-Protein Interactions1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 2 Quiz6 分
3
2時間で修了

Protein Structure

The determination of a protein's tertiary structure in three dimensions can tell us a lot about the biology of that protein. In this module's mini-lecture, we'll talk about some different methods used to determine a protein's tertiary structure and cover the main database for protein structure data, the PDB. In the lab we'll explore the PDB and an online tool for searching for structural (as opposed to sequence) similarity, VAST. We'll then use a nice piece of stand-alone software, PyMOL, to explore several protein structures in more detail.

...
4件のビデオ (合計32分), 2 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture13 分
Lab Discussion16 分
Summary1 分
2件の学習用教材
Lecture Materials10 分
Lab 3 -- Structural Bioinformatics1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 3 Quiz6 分
4
10分で修了

Review: Protein Motifs, Protein-Protein Interactions, and Protein Structure

...
1 quiz
1の練習問題
Quiz: Protein Motifs, Protein-Protein Interactions, and Protein Structure10 分
4.7
39件のレビューChevron Right

20%

コース終了後に新しいキャリアをスタートした

25%

コースが具体的なキャリアアップにつながった

11%

昇給や昇進につながった

Bioinformatic Methods II からの人気レビュー

by RGApr 6th 2017

Gives the student real world exposure to the tools to study proteins gene regulation, etc. Instructor is involved and friendly. Highly recommended for someone who is interested in contemporary

by NMJan 9th 2018

Hi Nicholas, Thank you so much for giving a lot of information. Bioinformatic Methods II was little difficult but understood after repeating the lad discussions. Thanks a lot.

講師

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Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

トロント大学(University of Toronto)について

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

よくある質問

  • 修了証に登録すると、すべてのビデオ、テスト、およびプログラミング課題(該当する場合)にアクセスできます。ピアレビュー課題は、セッションが開始してからのみ、提出およびレビューできます。購入せずにコースを検討することを選択する場合、特定の課題にアクセスすることはできません。

  • 修了証を購入する際、コースのすべての教材(採点課題を含む)にアクセスできます。コースを完了すると、電子修了証が成果のページに追加されます。そこから修了証を印刷したり、LinkedInのプロフィールに追加したりできます。コースの内容の閲覧のみを希望する場合は、無料でコースを聴講できます。

さらに質問がある場合は、受講者向けヘルプセンターにアクセスしてください。