3D SARS-CoV-19 Protein Visualization With Biopython

4.6
54件の評価
提供:
Coursera Project Network
このガイド付きプロジェクトでは、次のことを行います。

Biological sequence/ Data manipulation with Biopython

Query Biological Databases using Biopython & web-scraping

Create an interactive 3D model of SARS-CoV-19 Protein

Clock2 hours
Intermediate中級
Cloudダウンロード不要
Video分割画面ビデオ
Comment Dots英語
Laptopデスクトップのみ

In this project you will create an interactive three-dimensional (3D) representation of SARS-CoV-19 (Coronavirus) protein structures & publication-quality pictures of the same, understand properties of SARS-CoV-19 genome, handle biological sequence data stored in FASTA & PDB (Protein Data Bank) and XML format, and get insights from this data using Biopython. This hands-on project will also give you a glimpse of tasks a Bioinformatician performs on a daily basis, along with the up-to-date concepts and database use cases in the field of Medical Research and Human genetics. In this project, we will also cover basics about important databases used by biologists and biotechnologists, along with the type of sequence data we can access and visualize from these databases using Biopython & Jupyter notebook.

あなたが開発するスキル

  • SARS-CoV-19
  • Biopython
  • Python Programming
  • Bioinformatics
  • Biotechnology

ステップバイステップで学習します

ワークエリアを使用した分割画面で再生するビデオでは、講師がこれらの手順を説明します。

  1. Introduction to Biopython

  2. Understand FASTA file format

  3. Sequence manipulation using Biopython

  4. Transcription & Translation studies

  5. Perform Basic Local Alignment using NCBI-BLAST

  6. Reading PDB file

  7. Visualizing SARS-CoV-19 Protein structures

ガイド付きプロジェクトの仕組み

ワークスペースは、ブラウザに完全にロードされたクラウドデスクトップですので、ダウンロードは不要です

分割画面のビデオで、講師が手順ごとにガイドします

レビュー

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よくある質問

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