Access Bioinformatics Databases with Biopython

提供:
Coursera Project Network
このガイド付きプロジェクトでは、次のことを行います。

Sequence alignment using NCBI-BLAST

Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ, PDB, EXPASY

Access KEGG pathways and genes

Clock1 hour
Intermediate中級
Cloudダウンロード不要
Video分割画面ビデオ
Comment Dots英語
Laptopデスクトップのみ

In this 1-hour long project-based course, you will learn how to access, parse, and visualize data from various bioinformatics sequence and structural online databases such as ENTREZ, PDB, KEGG and NCBI using Biopython. You will also interact with various bioinformatics file formats such as FASTA, PDB, GENBANK and XML along with various parsers to read and modify these files using Biopython. Note: This course works best for learners who are based in the North America region. We’re currently working on providing the same experience in other regions.

あなたが開発するスキル

  • Bioinformatics
  • Python Programming
  • access biological database

ステップバイステップで学習します

ワークエリアを使用した分割画面で再生するビデオでは、講師がこれらの手順を説明します。

  1. Sequence alignment using NCBI-BLAST

  2. Fetch PUBMED & Nucleotide sequence using ENTREZ

  3. Fetch proteins from PDB

  4. PROSITE & SCANPROSITE from EXPASY

  5. Access KEGG database

ガイド付きプロジェクトの仕組み

ワークスペースは、ブラウザに完全にロードされたクラウドデスクトップですので、ダウンロードは不要です

分割画面のビデオで、講師が手順ごとにガイドします

よくある質問

よくある質問

さらに質問がある場合は、受講者ヘルプセンターにアクセスしてください。