このコースについて
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初級レベル

約13時間で修了

推奨:12-18 hours videos and labs...

英語

字幕:英語

習得するスキル

Genetic AnalysisBioinformatics AnalysisEvolutionComparative Genomics

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シラバス - 本コースの学習内容

1
3時間で修了

NCBI/Blast I

In this module we'll be exploring the amazing resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information, run by the National Library of Medicine in the USA. We'll also be doing a Blast search to find similar sequences in the enormous NR sequence database. We can use similar sequences to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function.

...
4件のビデオ (合計52分), 4 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture25 分
Summary
4件の学習用教材
Acknowledgements10 分
Course Logistics10 分
Lecture Materials10 分
Lab 1 -- Exploring NCBI1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 1 Quiz6 分
2
3時間で修了

Blast II/Comparative Genomics

In this module we'll continue exploring the incredible resources available at NCBI, the National Centre for Biotechnology Information. We will be performing several different kinds of Blast searches: BlastP, PSI-Blast, and Translated Blast. We can use similar sequences identified by such methods to infer homology, which is the primary predictor of gene or protein function. We'll also be comparing parts of the genomes of a couple of different species, to see how similar they are.

...
4件のビデオ (合計58分), 2 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture32 分
Summary
2件の学習用教材
Lecture Materials10 分
Lab 2 -- Advanced Blast and Comparative Genomics1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 2 Quiz6 分
3
2時間で修了

Multiple Sequence Alignments

In this module we'll be doing multiple sequence alignments with Clustal (as implemented in MEGA), DiAlign, and MAFFT. Multiple sequences alignments can tell you where in a sequence the conserved and variable regions are, which is important for understanding the biology of the sequences under investigation. It also has practical applications, such as being able to design PCR primers that will amplify sequences from a number of different species, for example.

...
4件のビデオ (合計42分), 2 readings, 1 quiz
4件のビデオ
Lecture23 分
Summary
2件の学習用教材
Lecture Materials10 分
Lab 3 -- Multiple Sequence Alignment1 時間 30 分
1の練習問題
Lab 3 Quiz6 分
4
10分で修了

Review: NCBI/Blast I, Blast II/Comparative Genetics, and Multiple Sequence Alignments

...
1 quiz
1の練習問題
Quiz: Modules 1-310 分
4.7
158件のレビューChevron Right

21%

コース終了後に新しいキャリアをスタートした

29%

コースが具体的なキャリアアップにつながった

20%

昇給や昇進につながった

Bioinformatic Methods I からの人気レビュー

by EDApr 27th 2017

Great course. All lectures provide a biological context for the tools you learn in the labs. The labs themselves provide a great introduction to the many tools available for bioinformatic analysis.

by FJFeb 6th 2017

The videos were very clear on how to use various bioinformatic tools. I found no difficulty in understanding them. Really enjoyed the course. Looking forward to the next part of this course!

講師

Avatar

Nicholas James Provart

Professor
Cell & Systems Biology

トロント大学(University of Toronto)について

Established in 1827, the University of Toronto is one of the world’s leading universities, renowned for its excellence in teaching, research, innovation and entrepreneurship, as well as its impact on economic prosperity and social well-being around the globe. ...

よくある質問

  • 修了証に登録すると、すべてのビデオ、テスト、およびプログラミング課題(該当する場合)にアクセスできます。ピアレビュー課題は、セッションが開始してからのみ、提出およびレビューできます。購入せずにコースを検討することを選択する場合、特定の課題にアクセスすることはできません。

  • 修了証を購入する際、コースのすべての教材(採点課題を含む)にアクセスできます。コースを完了すると、電子修了証が成果のページに追加されます。そこから修了証を印刷したり、LinkedInのプロフィールに追加したりできます。コースの内容の閲覧のみを希望する場合は、無料でコースを聴講できます。

さらに質問がある場合は、受講者向けヘルプセンターにアクセスしてください。