このコースについて
10,816 最近の表示

次における8の6コース

100%オンライン

自分のスケジュールですぐに学習を始めてください。

柔軟性のある期限

スケジュールに従って期限をリセットします。

約16時間で修了

英語

字幕:英語

習得するスキル

BioinformaticsBioconductorGenomicsR Programming

次における8の6コース

100%オンライン

自分のスケジュールですぐに学習を始めてください。

柔軟性のある期限

スケジュールに従って期限をリセットします。

約16時間で修了

英語

字幕:英語

シラバス - 本コースの学習内容

1
3時間で修了

Week One

The class will cover how to install and use Bioconductor software. We will discuss common data structures, including ExpressionSets, SummarizedExperiment and GRanges used across several types of analyses....
16件のビデオ (合計126分), 3 readings, 1 quiz
16件のビデオ
Installing R on A Mac 2 分
Installing R Studio on a Mac 1 分
What is Bioconductor7 分
Installing Bioconductor3 分
The Bioconductor Website9 分
Useful Online Resources5 分
R Base Types18 分
GRanges - Overview4 分
IRanges - Basic Usage12 分
GenomicRanges - GRanges8 分
GenomicRanges - Basic GRanges Usage8 分
GenomicRanges - seqinfo6 分
AnnotationHub8 分
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 112 分
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 213 分
3件の学習用教材
Welcome10 分
Syllabus10 分
Pre Course Survey10 分
1の練習問題
Quiz 120 分
2
2時間で修了

Week Two

In this week we will learn how to represent and compute on biological sequences, both at the whole-genome level and at the level of millions of short reads....
8件のビデオ (合計81分), 1 quiz
8件のビデオ
BSgenome6 分
Biostrings - Matching6 分
BSgenome - Views9 分
GenomicRanges - Rle12 分
GenomicRanges - Lists6 分
GenomicFeatures18 分
rtracklayer - Data Import14 分
1の練習問題
Quiz 220 分
3
2時間で修了

Week Three

In this week we will cover Basic Data Types, ExpressionSet, biomaRt, and R S4....
9件のビデオ (合計79分), 1 quiz
9件のビデオ
Annotation Overview4 分
ExpressionSet Overview4 分
ExpressionSet9 分
SummarizedExperiment7 分
GEOquery6 分
biomaRt13 分
R S4 Classes16 分
R S4 Methods10 分
1の練習問題
Quiz 320 分
4
2時間で修了

Week Four

In this week, we will cover Getting data in Bioconductor, Rsamtools, oligo, limma, and minfi...
7件のビデオ (合計81分), 1 reading, 1 quiz
7件のビデオ
Short Read4 分
Rsamtools12 分
oligo14 分
limma16 分
minfi11 分
Count-based RNA-seq analysis15 分
1件の学習用教材
Post Course Survey10 分
1の練習問題
Quiz 420 分
4.0
36件のレビューChevron Right

人気のレビュー

by MAMar 12th 2016

Excellent introduction to Bioconductor. Thanks to the team. However, absence of inputs from TA or Instructor was felt in the discussion.

by ABApr 12th 2018

Amazing course, motivated me to use bio conductor for descriptive seq studies of DNA.

講師

Avatar

Kasper Daniel Hansen, PhD

Assistant Professor, Biostatistics and Genetic Medicine
Bloomberg School of Public Health

ジョンズ・ホプキンズ大学(Johns Hopkins University)について

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

Genomic Data Scienceの専門講座について

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Genomic Data Science

よくある質問

  • 修了証に登録すると、すべてのビデオ、テスト、およびプログラミング課題(該当する場合)にアクセスできます。ピアレビュー課題は、セッションが開始してからのみ、提出およびレビューできます。購入せずにコースを検討することを選択する場合、特定の課題にアクセスすることはできません。

  • コースに登録する際、専門講座のすべてのコースにアクセスできます。コースの完了時には修了証を取得できます。電子修了証が成果のページに追加され、そこから修了証を印刷したり、LinkedInのプロフィールに追加したりできます。コースの内容の閲覧のみを希望する場合は、無料でコースを聴講できます。

さらに質問がある場合は、受講者向けヘルプセンターにアクセスしてください。